由于新地机构，新地衙门不断涌现，朝廷的行政机构已经到了不能不改地地步，像吏部吧，管着官员的考核和升迁，这在以前那可是一个实权的衙门，现在呢，成了最六部中最清净的衙门，反倒是原来认为是最清净，也最没有油水的工部衙门简直忙的是热火朝天，今天修路，明天挖运河，再后天修黄河堤坝，忙忙碌碌进进出出，以前黄尊素还羡慕周顺昌是七部尚书中最悠闲的一个，现在反过来，六部加上理藩院没有人再比他忙了，朱影龙来之后世，深知基础建设的重要，故而在改革初始加大了对工部的重视，尤其是多灾多难的大明朝来说，一些防患于未然的大型工程是绝对不能掉以轻心的，特别还在工部下面挂靠了一个防汛指挥厅的机构，著名水利专家袁应泰主持整个大明防汛以及防汛工程建设的工作。

改组内阁，改革六部，还有京城许多衙门一下子都换了名字，内阁该承政务院，设政务院总理大臣一人，副总理大臣四人，总理大臣徐光启，副总理大臣：黄尊素、孙慎行、杨鹤、周顺昌，理藩院改称外交　部，刘鸿训称总理外交尚书大臣，六部之中，户部改称财政部，下设几个税司，帝国中央银行，财政尚书大臣还是孙慎行，工部分拆，一为水利部，袁应泰为尚书大臣，一为交通建设部，尚书大臣任为周顺昌，刑部不动，不过增加一部为巡检部，统领整个大明朝所有的巡检司（拿现在来说就是公安部），吏部暂不动，礼部更名为教育部，主管全国教育以及科举人才的选拔，在这七部的基础上增加工商部、科技部和农业　部，这十部隶属新成立的政务院，另外都察院、通政司、太仆寺、大理寺等都有一些变动，只不过暂时没有更名，就拿大理寺来说，它的职能相当于最高法院和最高军事法庭，但因为军政的分开，所以大理寺其实已经变成了两个不同的审讯机构，分左右二丞，只不过军制改革还未完成，这军民两个审讯机构暂时还没有分开，还有通政司，他的职能基本上完全被邮政司取代，只不过他暂时还肩负了百姓直接上达天听的重　任，故而才留了下来，拿后世的职能来说，这个衙门应该称上访司才比较确切。

至于太子东宫詹事府，还有像教坊司这样的衙门能精简的就精简，不能精简就暂留一个空架子，派个把年纪大的，没什么才能的官员看着就行了。

崇祯四年，朱影龙这一连串的军政改革令天下震惊，这些改革可以说一旦完成，就将告别一个旧的时代，而大明帝国也会在新的时代中浴火重生。

阻力不可能没有，一是在阻力还没有形成的时候，即时掐灭，这个工作自然由行走在黑暗中的暗影和鹰卫去做，二呢，杀一儆百，朱影龙从来就不怕杀人，他自己也曾轻手杀过人，凡是阻碍自己改革的人，不论是官还是民，只有一条路，从这个世界上消失。

只要过了改革最初的阵痛期，相信一切都会好起来，前提是国家不能发生内乱。